Détection par PCR en temps réel de l’ensemble des souches d’Helicobacter chez le rat et la souris de laboratoire
et/ou Détection spécifique par PCR en temps réel d’ Helicobacter hepaticus.
Typage de la(des) souche(s) impliquée(s) dans l’infection.
Indications du test
- Diagnostic des infections à Helicobacter spp. dans le cadre des recommandations FELASA (Federation of European Laboratory Science Associations) et en particulier de H. hepaticus, H. bilis, H. muridarum, F. rappini, H. rodentium et H. trogontum. La présence de ces bactéries peut interférer avec les résultats expérimentaux
- Diagnostic d’une infection à Helicobacter chez un animal symptomatique
- Evaluation du risque épidémiologique (mise en évidence de la circulation bactérienne en animalerie)
- Epidémiologie moléculaire : origine et traçabilité d’une infection
Caractéristiques du test
- RT-PCR en temps réel Helicobacter spp. : détection de toutes les souches d’Helicobacter
- RT-PCR en temps réel Helicobacter hepaticus : détection spécifique de H. hepaticus
- Seuil de détection
- Analyse quantitative possibles (sur demande)
- Typage possible de la(des) souche(s) majoritairement amplifiée(s) par séquençage et recherche d’homologie de séquence
Prélèvements à réaliser
- Paroi de caecum (non fixée) : les prélèvements de 2 à 3 animaux peuvent être groupés afin de réduire le coût des analyses
- Fèces de cage ou individuels (sans milieu de transport)
- Prélèvements environnementaux
Interprétation du résultat
- Résultat positif : l’animal ou les animaux sont infectés par une espèce d’Helicobacter .
La confirmation ou l’exclusion de la présence d’ H. hepaticus peut alors être réalisée par PCR en temps réel.
Un typage par séquençage et recherche d’homologies de séquence permet l’identification de la(des) souche(s) impliquée(s) dans l’infection. - Résultat négatif : compatible avec des animaux « Helicobacter free » (ou quantité inférieure au seuil de détection du test)
Ne pas hésiter à nous consulter pour une interprétation du résultat quantitatif